細菌可以根據它們的形態、生長特性以及對染色劑的反應來分類。根據形態分類，細菌可以分為球菌、桿菌和螺旋菌；根據生長特性分類，細菌可以分為需氧菌、厭氧菌和兼性厭氧菌；根據對染色劑的反應來分類，細菌可以分為革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌。