腸道內的菌群包括多種細菌、真菌、病毒和寄生蟲等微生物，其中最主要的是以下幾類菌群：

　　1. Bacteroidetes：產生酵素分解食物，幫助消化碳水化合物、蛋白質和脂肪等營養物質。

　　2. Firmicutes：可以分解復雜的營養物質，如纖維素、淀粉質和蛋白質，同時也可以產生有益的代謝產物。

　　3. Proteobacteria：這一類菌群包括大腸桿菌等病原菌和產生一些有害代謝產物的細菌，但也有一些對人體有益的細菌。

　　4. Actinobacteria：產生抗生素和能減少外來病原體數量的化合物，同時也能改善腸道環境。

　　5. Verrucomicrobia：產生黏液，增加腸道黏膜層，同時也能代謝一些營養物質。

　　不同菌群的比例和數量也會因人而異，腸道內微生物的種類更多，豐富多樣的菌群組合有益于身體健康。