其實許多疾病尤其是慢性疾病都與腸道菌群失調有關。隨著年齡增長，飲食排泄無規律以及疾病等，導致雙歧桿菌數量減少，有害病菌大量繁殖。引起菌群失調的原因有很多，總結起來是以下幾種：

　　1、飲食因素：運用測定細菌酶類的方法研究菌叢代謝活性的結果表明，飲食可使糞便菌叢發生明顯改變。無纖維食物能促進細菌易位。

　　2、年齡因素：隨著年齡的增高，腸道菌群的平衡可發生改變，雙尾菌減少，產氣莢膜桿菌增加，前者有可能減弱對免疫機能的刺激，后者導致毒素增加使免疫受到抑制。老年人如能維持年青時的腸道菌群平衡，也許能夠提高免疫能力。

　　3、藥物的代謝因素：任何抗生素都可導致結腸菌叢的改變，其取決于藥物的抗菌譜及其在腸腔內的濃度。

　　4、胃腸道免疫功能障礙因素：胃腸道正常免疫功能來自粘膜固有層的漿細胞，漿細胞能產生大量的免疫球蛋白，即分泌型IgA，此為胃腸道防止細菌侵入的主要物質。一旦功能出現障礙則可引起小腸內需氧菌與厭氧菌過度繁殖，從而造成菌群失調。

　　調理體內菌群失調的根本在于為體內有益菌提供營養，促進其自身繁殖。